Autour d’une direction générale et de services administratifs, l’Agence est organisée en deux directions :Ingénierie et Développement, Marketing et Partenariats. Elle dispose également d’un Observatoire du Tourisme.

L’Administration Générale est pilotée par le Directeur Général.

Ce service regroupe plusieurs entités :

- La gestion administrative et financière de l’établissement,
- Les ressources humaines,
- Les affaires juridiques,
- La communication institutionnelle et interne,
- L’Observatoire du Tourisme.

L’Agence du Tourisme de la Corse assure, dans un rôle de coordination du tourisme de l’île, trois missions principales :

La promotion de la destination Corse sur tous les marchés et une stimulation de la demande qui s’exerce aujourd’hui sur 17 pays et principalement sur les marchés de proximité européens. L’Agence du Tourisme mène ainsi des campagnes de communication ciblées, participe à des salons et workshops où elle joue un rôle d’ensemblier, met en relation offre et demande, accueille des médias en Corse et édite un certain nombre de documents promotionnels multilingues à destination des publics. Consciente de l’importance de la sphère Internet, l’Agence du Tourisme a créé et gère intégralement depuis quelques années le portail touristique de l’île « visit-corsica.com » qui permet à une offre diffuse et essentiellement familiale et indépendante de pouvoir être présente sur la vitrine officielle du tourisme insulaire.

En charge de l’image de l’île, les opérateurs eux-mêmes étant responsables de leur commercialisation, l’Agence du Tourisme a dès l’année 2000 résolument axé sa communication sur les valeurs différenciatrices de la Corse par rapport à ses concurrents soit : un environnement préservé, une destination de caractère et un tourisme à dimension humaine, loin des destinations standardisées et quelquefois aseptisées. Ce parti pris, issu des Conférences Régionales sur le tourisme a permis à la Corse d’asseoir un véritable positionnement discriminant en prenant très tôt l’axe du développement durable qui se confirme aujourd’hui comme une tendance lourde des marchés de demain.

La mission relative au développement de l’offre touristique, concerne les aménagements publics ainsi que les projets privés, dès lors qu’ils rentrent dans les politiques de soutien de la Collectivité Territoriale de Corse votées en Assemblée de Corse.

Ces politiques sont visées dans le plan de développement de la Corse et sont traduites en terme d’interventions financières dans les règlements d’aides au tourisme. Parmi ses interventions, l’Agence porte et soutient une politique d’organisation du tourisme sur le territoire dans un regroupement micro-régional , mutualisant les énergies et actions autour de pôles pertinents.

Elle insiste également tout particulièrement sur les projets d’aménagements structurants comme les ports de plaisance, les golfs, les structures de tourisme d’affaires, la pleine nature, … autant de segments visant à étaler l’activité tout au long de l’année.

Enfin, elle encourage l’ensemble de l’offre à augmenter les capacités d’hébergement de caractère en espace rural et à élever son niveau qualitatif sur l'ensemble du territoire. Sur ce dernier point, l’Agence du Tourisme souhaite entraîner l’ensemble de l’offre corse au sein de la marque régionale « Qualité Corse » qu’elle a créée et gère cette marque impose une exigence en terme de professionnalisme, la prise en compte du développement durable et l’affirmation d’une identité propre, autant d’éléments jugés déterminants pour se positionner au mieux dans un environnement concurrentiel très disputé en Méditerranée.

Dans ses fonctions, l’observatoire publie un certain nombre de dossiers et d’analyses qui enrichissent les stratégies et actions et réalise des études thématiques. Il forme un véritable centre de ressources pour tous les acteurs concernés par le tourisme.